Ngọn hải đăng đầu tiên hoạt động vào năm 1872,[1] và được thiết kế bởi Richard Henry Brunton, người được thuê bởi chính phủ Nhật Bản vào đầu thời kỳ Minh Trị xây dựng ngọn hải đăng giúp đảm bảo an toàn hàng hải cho các tàu nước ngoài khi đi qua khu vực.[2]

Năm 2015, cùng với nhiều địa danh khác tại Nhật Bản, hải đăng Mutsurejima là một phần của Các địa điểm của Cải cách Công nghiệp Minh Trị tại Nhật Bản: Sắt thép, Đóng tàu và Khai mỏ được UNESCO công nhận là Di sản thế giới.[3][4]